Năm vương quốc đang sinh sống chan hòa với nhau bất ngờ bị tấn công bởi thế lực Đế chế Ngầm Bugnarak, kẻ trở lại sau khi bị đánh bại từ 2000 năm trước đây.
Pokemon Movie 05: Mizu no Miyako no Mamorigami Latias to Latios, Pokémon Heroes, Gekijouban Pocket Monsters: Mizu no Miyako Mamorigami Latias to Latios, Pokemon Movie 5